甜菜对肥料非常敏感，施肥对甜菜产量影响很大，仅次于水分的影响。氮磷钾三种营养元素是甜菜生长发育的主要养分，根据甜菜的生理特点，合理配置氮磷钾施用时期和比例是保障甜菜高产高糖的关键点。那么，甜菜如何施肥才能够实现高产高糖呢？
一、以有机肥为主，配施化肥
有研究显示，有机肥的施用量和甜菜块根产量1:1时（即产1kg甜菜块根施用1kg有机肥），产量最高、含糖量最高。但由于各种因素限制，生产上每亩地很难施用七八吨甚至十吨的有机肥，一般而言，每亩施用3～4吨充分腐熟的农家肥、厩肥或土杂肥即可，或者每亩施用1.5～2吨商品有机肥即可。对于农家肥匮乏，无力购买商品有机肥的地区，可以通过种植绿肥和秸秆还田增加土壤的有机质含量，提高土壤肥力。
二、有机肥做基肥，化肥做种肥和追肥为辅
在施用有机肥做基肥时，按照每亩20kg的量配施尿素，按照每亩15kg的量配施磷肥（过磷酸钙），按照10kg的量配施加肥。每亩用5-8kg的磷肥做种肥，用10-15kg的尿素和8-10kg的硫酸钾做追肥。
种肥：甜菜出苗30-40天，处于幼苗期，对肥料非常敏感，尤其对磷肥比较敏感，由于基肥施用较深，甜菜幼苗根系尚浅，无法吸收到深处的磷肥，需要在表层土壤施用磷肥使根系就近吸收磷元素，有利于根系发育。按照每亩5-8kg的过磷酸钙施用，为防止烧苗，种肥应离甜菜幼苗根茎5-8cm施用，施肥时开沟深度5-10cm，施肥后覆土即可。
追肥：追肥以氮肥为主，配施磷肥和钾肥。追肥的次数和数量根茎甜菜生长情况、土壤肥力和基肥用量决定。一般在甜菜定苗后浇头水前结合中耕开沟追肥，每亩追施尿素15-20kg，过磷酸钙5-7kg。第二次追肥根据苗情，结合第二次灌水，撒施3-5kg尿素。
三、氮磷钾比例应当协调
甜菜不同时期对氮磷钾的需求比例不同，单一过量施用氮肥不仅无法提高产量，反而会导致产量下降，糖分含量显著下降。因此，甜菜施肥应当控制氮肥用量，做到氮磷钾比例协调，对于磷钾肥含量低的土壤应适度提高磷钾肥用量。
四、重视微量元素肥的施用
有研究表明，在苗期、叶丛繁茂期、块根膨大期喷施微量元素肥能够明显提高甜菜块根产量和含糖量，因此，应重视微量元素肥的施用。